
本套课程来自网易课堂Perl语言高级编程(生物信息) 视频教程,课程官方售价:49元。 本套课程适用人群:科研数据,学生,老师,需要用Perl做文本处理和数据分析等人群。
课程概述
本课程介绍perl 语言的高级用法,以发表文章方法做为示例,展示如何用perl处理生物大数据,编写自动化分析流程。
学习之后您获得高效的文本处理方法,读取复杂数据的能力,处理生物数据的技巧,编写流程,整理各种软件的输入输出文件,实现数据的自动化处理,高效的分析数据,快人一步,节约宝贵科研时间。
0基础的同学,先看课程《Perl语言快速入门(生物信息)》
本课程具体内容目录如下:
1.perl 正则表达式
各种通配符介绍
在editplus中应用,不学编程也能利用正则表达式快速整理文本文件
perl中正则表达式应用(搜索,转换,替换,捕获,计数等)
2 复杂数据的读取与操作
perl引用的用法
读取复杂基因数据到变量中并处理
数据读取随心所欲
3. bioperl应用
面向对象的编程
fasta数据的读取与处理
序列截取
序列反向互补
DNA序列翻译成蛋白质序列
4.综合应用案例 -> 自动化分析流程搭建
生物信息数据库文章解读
引物设计
SSR查找misa使用
primer3使用
搭建引物批量设计流程
课程文件目录:
1、课程介绍.mp4
2、正则表达式初步及示例操作.mp4
3、windows中正则表达式高级应用.mp4
4、perl正则表达式应用.mp4
5、perl引用的用法.mp4
5、reg.pl
6、bioperl使用.mp4
7、参考文献了解方法(植物SSR数据库).mp4
8、PMDBase.pdf
8、基因组中SSR查找及misa使用介绍.mp4
9、引物设计介绍及primer3使用说明.mp4
10、e-PCR使用和引物验证筛选.mp4
10、primer3.input
11、perl流程编写-SSR查找和引物设计(上).mp4
12、perl流程编写-SSR查找和引物设计(下).mp4
课程资料
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