2021年度扩增子16S分析

本套课程为网易云课堂：2021年度扩增子16S分析，课程官方售价4500元。适合人群：对微生物组有概念性了解。有学习扩增子组分析的决心和时间安排。

课程概述

生信宝典组织中科院一线科研人员进行的理论加实战，线上线下相结合的培训的线上版。微生物扩增子分析高通量测序实验讲解和生信分析实战，及微生物组多样性可视化和功能分析的绝好课程。

从分析平台搭建、Linux和R基础、图表解读和实战、扩增子分析标准流程、功能预测、统计分析以及各类高级分析(进化树、网络、环境因子、机器学习等)，和CNS级图片修改排版。

课程目录：

|– {1}–扩增子分析平台搭建（软件安装）
[1.1]–扩增子分析平台搭建-WindowsMac系统.mp4
|– {2}–R和Linux简介
[2.1]–R简介和统计绘图实操.mp4
[2.2]–Linux简介和实操.mp4
|– {3}–扩增子分析背景知识介绍
[3.1]–扩增子分析基本概念1.mp4
[3.3]–扩增子分析基本概念3.mp4
[3.4]–扩增子流程理论.mp4
[3.5]–21-1简介生信-微生物组——0530.mp4
[3.6]–21-2扩增子测序引物选择——0530.mp4
[3.7]–21-3扩增子流程概述——0530.mp4
[3.8]–扩增子分析流程介绍1——0814.mp4
[3.9]–扩增子分析流程介绍2——0814.mp4
[3.10]–扩增子分析流程介绍3——0814.mp4
[3.11]–扩增子分析流程介绍1-20210409.mp4
[3.12]–扩增子分析流程介绍2-20210409.mp4
[3.13]–扩增子分析流程介绍3-20210409.mp4
|– {4}–常用图形绘制和解读
[4.1]–扩增子常见图形解读.mp4
[4.2]–扩增子常见图形解读——0816.mp4
[4.2]–扩增子常见图形解读——0816.mp4.baiduyun.uploading.cfg
|– {5}–扩增子16S分析分析流程讲解
[5.1]–扩增子分析流程讲解–OTU鉴定和定量.mp4
[5.2]–扩增子分析流程讲解–有参分析、多样性分析等.mp4
[5.3]–扩增子分析背景知识介绍——0815.mp4
|– {6}–测试数据到OTU表
[6.1]–扩增子流程理论-生成OTU表.mp4
[6.2]–扩增子流程实操-生成OTU表.mp4
[6.3]–22-1样本准备——0530.mp4
[6.4]–22-2特征表——0530.mp4
[6.5]–22-3多样性计算——0530.mp4
[6.6]–扩增子流程1——0815.mp4
[6.7]–扩增子流程2——0815.mp4
|– {7}–物种多样性分析
[7.1]–扩增子流程-alpha多样性.mp4
[7.2]–扩增子流程-beta多样性.mp4
[7.3]–扩增子流程-物种组成.mp4
[7.4]–23-1alpha多样性绘制——0530.mp4
[7.5]–23-2Beta多样性绘制——0530.mp4
[7.6]–23-3物种组成绘制——0530.mp4
[7.7]–Diversity——0815.mp4
[7.8]–Diversity-RMD——0815.mp4
|– {8}–LefSe和STAMp差异分析
[8.1]–扩增子流程-R差异分析.mp4
[8.2]–扩增子流程-STAMP差异分析.mp4
[8.3]–扩增子流程-lefse差异分析.mp4
[8.4]–24-1R差异比较——0530.mp4
[8.5]–24-2STAMP——0530.mp4
[8.6]–24-3LEfSE——0530.mp4
[8.7]–差异分析R——0815.mp4
[8.8]–差异分析STAMP——0815.mp4
|– {9}–QIIME2扩增子分析流程
[9.1]–25QIIME2-1流程简介PPT——0530.mp4
[9.2]–25QIIME2-2完整分析流程——0530.mp4
[9.3]–25QIIME2-3外部导入特征表和结果比较——0530.mp4
|– {10}–功能预测
[10.1]–表型预测-bugbase.mp4
[10.2]–元素循环-faprotax.mp4
[10.3]–功能预测-picrust.mp4
[10.4]–24-4BugBase——0530.mp4
[10.5]–31-1功能picrust——0531.mp4
[10.6]–31-2功能farprotax——0531.mp4
[10.7]–功能预测1PICRUSt——0816.mp4
[10.8]–功能预测2FARPROTAX——0816.mp4
[10.9]–功能预测3Bugbase——0816.mp4
|– {11}–网络分析方法在群落生态学中的应用
[11.1]–网络分析理论1——0530.mp4
[11.2]–网络分析理论2——0530.mp4
[11.3]–网络分析理论3——0530.mp4
[11.4]–网络分析理论实操——0530.mp4
[11.5]–网络分析-19年.mp4
|– {12}–机器学习分类与回归
[12.1]–机器学习.mp4
[12.2]–33随机森林——0530.mp4
[12.3]–机器学习——0817.mp4
|– {13}–系统发育树构建与美化
[13.1]–进化树的构建和美化.mp4
|– {14}–环境因子分析
[14.1]–环境因子.mp4
|– {15}–论文图表的修改（AdobeIllustrator）
[15.1]–AI.mp4
[15.2]–AI——0816.mp4
|– {16}–Cytoscape
[16.1]–Cytoscape使用.mp4
[16.2]–Cytoscape——0816.mp4
|– {17}–扩增子1204期
[17.1]–扩增子流程概述-1204.mp4
[17.2]–定量生成OTU表-1204.mp4
[17.3]–流程之可视化-1204.mp4
[17.4]–Cytoscape——1204.mp4
[17.5]–扩增子常见图形解读——1204.mp4
[17.6]–扩增子背景知识介绍-1205.mp4
[17.7]–原始数据生成otu表-1205.mp4
[17.8]–原始数据生成otu表to多样性-1205.mp4
[17.9]–多样性分析-1205.mp4
[17.10]–R差异比较-1205.mp4
[17.11]–QIIME2-1205.mp4
[17.12]–Picrust1206.mp4
[17.13]–Faprotax_bugbase1206.mp4
[17.14]–随机森林1206.mp4
[17.15]–溯源和马尔科夫链实操1206.mp4
[17.16]–溯源-1206.mp4
[17.17]–马尔科夫链-1206.mp4
|– {18}–20210409-20210411期
[18.1]–0409扩增子概述1.mp4
[18.2]–0409扩增子概述2.mp4
[18.3]–0409扩增子概述3.mp4
[18.4]–0409扩增子软件、流程测试.mp4
[18.5]–0409扩增子流程图形解读.mp4
[18.6]–0409扩增子图形解读2.mp4
[18.7]–0409扩增子Cytoscape.mp4
[18.8]–0409扩增子AI.mp4
[18.9]–0410扩增子背景介绍.mp4
[18.10]–0410扩增子流程1.mp4
[18.11]–0410扩增子流程2.mp4
[18.12]–0410扩增子多样性分析.mp4
[18.13]–0410扩增子差异分析.mp4
[18.14]–0411qiime-1.mp4
[18.15]–0411qiime-2.mp4
[18.16]–0411功能预测-pircust.mp4
[18.17]–0411功能预测-Farprotax.mp4
[18.18]–0411功能预测-bugbase.mp4
[18.19]–0411随机森林.mp4
[18.20]–0411MicroEco.mp4
[18.21]–0411进化树.mp4
|– {19}–20210723-20210725期
[19.1]–01-扩增子-基础理论概述.mp4
[19.2]–02-1扩增子软件安装-20210711.mp4
[19.3]–02-2扩增子运行环境配置.mp4
[19.4]–03-扩增子-软件安装和测试02.mp4
[19.5]–04-扩增子-图形解读1.mp4
[19.6]–05-扩增子-图形解读2.mp4
[19.7]–06-扩增子-cytoscape菌群共存和菌群Binary网络.mp4
[19.8]–07-扩增子-AI.mp4
[19.9]–08-21-扩增子概述.mp4
[19.10]–09-22-扩增子分析流程获得OTU表.mp4
[19.11]–10-23-扩增子分析流程多样性理论和实战.mp4
[19.12]–11-24-扩增子多样性理论.mp4
[19.13]–12-25-差异菌群分析RedgeR.mp4
[19.14]–13-26-差异菌群分析STAMP.mp4
[19.15]–14-31-Picrust功能预测.mp4
[19.16]–15-31-Faprotax分析.mp4
[19.17]–16-32-Bugbase分析.mp4
[19.18]–17-33-机器学习.mp4
[19.19]–18-34-进化树.mp4
[19.20]–19-35-Qiime2.mp4